ООО Биарум
Data Analyst
Первое направление (классификация документов/извлечение данных для различных целей — по запросу заказчика):
Подготовка ПО к обработке больших данных (документы в отсканированном виде, текстовые документы и т.д.): создание тренировочных сетов для дальнейшей классификации, выделение (как визуально, так и контекстно) ключевых значений в документах для дальнейшего извлечения и последующей обработки (например, выделение необходимого перечня документов, которое определяется по периоду создания, либо по периоду окончания сроков действия, либо по заказчику/клиенту, по стоимости работ/услуг и т.д.). Работа с документами на английском языке по различным тематикам (bank statements, loans/mortgages/leesing, court documents, lab results, certificates of graduation, well reports, etc.).
Опыт программирования в создании скриптов на Python для обработки json файлов, получении данных через API.
Регулярное использование различных языков запросов и разметки (SQL, groovy, json, xml).
Большой опыт в написании regexp, solr queries.
Ручное тестирование разрабатываемого ПО.
Создание технической документации, ПО manuals.
Работа с технической документацией (и командами разработки) на английском языке.
Проведение тренингов по обучению для работы с помощью ПО.
Второе направление (извлечение данных из медицинских документов для подтверждения корректности диагноза, назначения препаратов/манипуляций, подсказки-коректировки):
Создание модулей для генерации пациентов c раком молочной железы (анализы на мутации в генах) в Synthea Module Builder. Изучение медицинских статей на pubmed для понимания влияния конкретных мутаций на постановку дигноза.
Подготовка подборки clinical trials для создания ПО по автоматическому предложению трайла при подходящих входных данных пациента.
Разработка правил для экстракции данных из медицинских документов согласно NCCN Guidelines. Получение записей о пациентах через запросы в Postman, испозьзование Fast Healthcare Interoperability Resources (FHIR) Specification, Logica Sandbox, UMLS metathesaurus.
Разработка бизнесс-процессов с помощью Camunda BPM (COVID-19 BPMN Flowchart
https://github.com/AlunaHealth/COVID-19).
Задачи, баги и т.п. в JIRA, Redmine, Trello, YouTrack.